1、
多效蒸餾水機的高壓泵即使有很短的時間中斷運轉都可能使裝置發生故障。
2、反滲透入口壓力要保持有適當的裕度，否則由于沒有適當的壓實，除鹽率會降低。
3、反滲透膜的水解易造成多效蒸餾水機的性能惡化，為此，要嚴格控制水的PH值，給水PH值在3-11范圍內。
4、若把FI值超標的水供給多效蒸餾水機作為給水，在膜組件的表面將附著污垢，這樣要通過清洗來去除污垢。
5、多效蒸餾水機停止時應用低壓給水置換多效蒸餾水機內的水。這是為了防止在停運時二氧化硅的析出(在冬季時水溫下降之故。。
6、當多效蒸餾水機入口和出口的壓差超過標準時，說明膜面已受污染或者是給水流量在設計值以上。如經流量調整尚不能解決壓差問題，則應對膜面進行清洗。
7、在夏天給水溫度高，產水流量就過多，有時不得不降低操作壓力，這樣做將導致產水水質下降。為了防止這點，可減少膜組件的根數，而操作壓力仍保持較高的水平。
8、需經常注意保安過濾器的壓差。出現壓差急劇上升的原因主要是保安過濾器渾濁度的泄漏。相反，出現壓差急劇下降的原因是過濾器元件的破損，以及保安過濾器元件緊固螺絲松動等。
9、當注入的次氯酸鈉量不足而使給水中的游離氯不能測出時，在多效蒸餾水機的膜組件上會有黏泥發生，多效蒸餾水機的壓差將增加。但對于聚酰胺膜來講，要嚴格控制進入膜組件的游離氯量，超過規定值將導致膜的氧化分解。
10、過量的給水流量將使膜組件提前劣化，因此給水流量不能超過設計標準值。此外濃水的流量應盡量避免小于設計標準值，在濃水流量過小的條件下運轉，會使多效蒸餾水機的壓力容器內發生不均勻的流動及由于過分濃縮而在膜組件上析出污垢。
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